2013年10月19日 星期六

如何計算Pearson's r的95%信賴區間

1. 使用R軟體:
(1)先把data匯入R (data是以csv檔儲存,以開啟檔案的方式把data檔案匯入)


> data=read.table(file.choose(),sep=',', header=TRUE)

(2)使用下列語法可算出Pearson's r及其95%CI(data儲存的方式是paired data,前測是data[,1],後測是data[,2])

> cor.test(data[,1],data[,2],method='pearson',
conf.level=0.95)

2. 使用SPSS軟體:
若要使用SPSS算出Pearson's r的95% CI,要先將資料做一點小處理。
(1) Analyze→Descriptives
選擇要做相關分析的二個變數,然後勾選"Save standardized values as variables",把變數先標準化。
(2) Analyze→Regression→Linear
以Linear Regression分析,將標準化的二個變數各放進"Dependent(依變項)"和 "Independent(獨變項)"(我是把後測的標準化變數放進依變項,前測的標準化變數放進獨變項)。
(3) 點選"Statistics",勾選Regression coefficients中的選項"Confidence intervals"(一般都是設定95% CI)。
(4) 點選"OK",即可得"Output",如下:
基本上我們若以linear regression來分析二變數的相關,只要找表格中的Beta值,就可知道二變數的相關係數是多少(就等於Beta值)。
經過標準化之後的變數,進行Linear Regression分析後,其B和Beta的值是一樣的(見表格),所以表格後面的"Confidence Interval  for B"其實就等同於"Confidence Interval for Beta"。
由上面表格可知,二變數的相關是0.802,相關係數的95% CI=-0.296~1.900。

註:以這個方式算出的95% CI,upper bound會有過大的現象(跟R軟體算出的值比較,但lower bound差不多)。

2013年10月18日 星期五

10/17討論記錄

ADL item bank不適合做成short form的原因:
1. IADL domain有很多,要選擇那些domain可能是一個問題,另外的問題是:IADL並不是每項皆必須從事,item的選擇也是一個困難點。
2. 在數學上要讓BADL+IADL呈現Unidimentionality是不困難的,Rasch不行還有2P,不然就是用non-parametric IRT model,如:Mokken。但數學上呈現單向度,不代表概念是單向度的,因為為了符合model,刪了一些題目,但是這些題目可能是很重要的(畢竟來自專家或病患的意見)。刪除了這些題目,可能使得ADL概念變得不完整。

2013年10月15日 星期二

10/14-18任務規劃




10/14 ()
10/15 ()
10/16 ()
10/17 ()
10/18 ()
9:00-11:00
收案
台大IRB (中山):
修改計畫書及同意書

收案/約個案
Balance CAT & Biodex論文 資料整理與分析
收案/約個案
11:00-12:00
Lynn英文
IRT論文
分類



13:00-15:30
收案
IRT論文
分類 &
IRT/CAT研究構想
收案
IRT論文
分類
注意力收案資料整理
16:00-17:00
亞東IRB
收案
台大IRB
上傳
(中山)
收案

本週IRT論文分類:PubMed 第501-700

2013年10月10日 星期四

中山研究助理對各評估工具熟悉程度及後續規畫

中山研究助理對各評估工具熟悉程度:
以下以0-10分代表助理對評估工具之熟悉狀況,越高分代表越熟悉:
平衡評估:
Berg Balance Scale: 6-7
Balance Item Bank/Balance CAT:  6-7
ADL評估:
BI/FAI: 8-9
ADL item Bank/ADL CAT: 8-9

基本上蔡助理在ADL的評估上還蠻熟練的!
因為有過臨床經驗,所以可以很自然地藉由與個案聊天做完ADL評估,
但可能要提醒她有些重點要記得說明,如:FAI有些項目是問過去半年,跟個案詢問時要加上時間的描述,以免個案說的只有最近的情況。
另外,問法上也要避免問個案「可不可以」,而是問「有沒有」。
平衡評估的熟悉度稍低一些。
其原因主要是助理對有些項目的評估方式還不是很熟悉,
評估流程也還不熟,但這些部分應該施測幾次之後就沒有問題了。

台語熟悉度:7-8分
在公衛大樓練習評估時,幫忙的學妹刻意以台語跟蔡助理對談,
蔡助理在台語的應對上還蠻不錯的,有些說法一開始不是很順,但多說幾次就很溜了。

關於未來施測流程和個案納入標準:
因為要評估的工具很多,所以請助理跟呂文賢老師詢問和討論:是否一次皆要測完這些評估工具?
或許可以分為二次,二天測完,如同她練習的方式:一次為Berg+ADL item bank/ADL CAT,一次為Balance item bank/Balance CAT+BI/FAI?
另外,個案是否一定要MMSE 23分以上才能納入?或許可以聽懂簡單指令執行平衡的項目,而BI/FAI/ADL item bank/ADL CAT可以詢問個案的照顧員?

後續規畫
1. 請助理製作個案的評估表格,一位個案一份,包含:個案基本資料表、各個評估工具的評估項目,再確定好收案程序後,依施測順序排列表格,製作個案的評估檔案。
註:蔡助理之前將我和Jenny給予她的評估項目整理得蠻不錯的,所以應該蠻有這方面的天份和興趣。

2. 由於IRB申請和通過還須一段時間,考慮在IRB通過前,或許聯絡之前曾經去評估過的一壽養護中心,跟他們詢問是否方便讓我們執行這些評估工具的練習,讓助理實際使用評估表格練習評估幾位個案和熟悉整個收案流程。
註:蔡助理過去一年的臨床經驗中有過在長照機構服務的經驗,所以對於長照機構的個案狀況還算熟悉。但收案和臨床作業可能有些不同,或許可以先練習一下整個收案流程。






2013年10月9日 星期三

中山研究助理訓練記錄及台大收案現況


中山研究助理訓練記錄:
早上進行了約1-2小時的講解(與Jenny一起),主要是釐清助理的疑問。
因助理本身已先閱讀Berg/Balance & ADL item bank/BI/FAI的施測內容,
且有一年的臨床經驗,
所以對於項目如何施測及給分大致上沒有問題,
僅對部分項目評分如何給予較不確定,
故我們僅針對這些項目的評分給予講解。

下午找了二位中風個案請助理練習施測,
一位個案是練習Berg/ADL item bank的施測,
另一位個案則是練習Balance item bank/BI/FAI的施測,
之後跟助理檢討施測過程或問法有哪些須更改,
並提供可能的施測流程(Berg),共花費約2個小時的時間。
回到公衛大樓後請一位碩班學妹幫忙當受試者,
練習Balance CAT和ADL CAT如何和Balance & ADL item bank一起施測,
大約花費1小時的時間。

以上訓練時間共約5小時。

台大收案現況:
由於目前我們收案的組數有點多(大致上為4組),
且可能會同時用到台大生理OT的二間小治療室,
造成臨床作業上有些不便,
故陳怡妙老師希望我們準備一個檔案夾,
放上現在我們研究室進行的研究內容和進行的時間,
然後放置在個案名單白板下面的鐵櫃上,
讓他們可以知道我們目前到底在進行哪些研究。
目前已經收集我們研究室所有研究的同意書(通過台大IRB的6個研究),
並補上臨床老師需要的資訊,將於星期五放置在指定的位置上。


2013年10月8日 星期二

IRT論文分類reorganization重點

1. 不看全文,只看Title和Abstract。
2. 分類須再清楚些,目前分類有overlap的狀況。大體來說,目前所分類的IRT論文大部分都屬於validation,所以目的和驗證不應作為二個分類項目。( 之後分類方向:論文目的清楚和驗證相關事項探討)
3. 看Title和Abstract不確定的就先放一邊,目前只要大略分類即可。

2013年10月7日 星期一

IRT論文分類狀況(10/7更新)

目前看了340篇論文,扣除與臨床不相關/comments/一般Rasch, IRT或效度驗證的論文,共分類了90篇。分類情況如下:

A. Purpose/Function of IRT/Rasch analysis: 45
1. improve reliability/precision/discrimination: 9篇
2. select/reduce items: 8篇
3. develop functional stages/health states: 8篇
4. clarify/confirm structure: 5篇
5. create interval scale: 2篇
6. cross calibration/co-calibration: 2篇
7. evaluate equivalency between response systems: 2篇
8. group comparison: 2篇
9. derive an  composite score: 1篇
10. evaluate crosscultural measurement equivalence: 1篇
11. evaluate temporal stability of structure: 1篇
12. link outcomes: 1篇
13. scale consolidation: 1篇
14. treatment planning: 1篇
15. analyze relationship:  1篇

B. Rasch/IRT validation-interesting issues/topics(Rasch/IRT驗證論文中,包含有趣或值得探討的議題): 11
1. DIF: 2篇
2.  rating scale design: 2篇
3. comparison between measures: 1篇
4. computerized cognitive test: 1篇
5. model fitting criteria: 1篇
6. '3- step IRT strategy': 1篇
7. measurement invariance analyses: 1篇
8. model choice: 1篇
9. small sample size: 1篇

C. Rasch/IRT concepts(論文中提及Rasch/IRT概念,值得精讀):7
1. cognition tests: 1篇
2. DIF: 1篇
3. macro & micro analysis: 1篇
4. PROMIS Item Bank Development and Testing Methodology: 1篇
5. psychiatry: 1篇
6. software: 1篇
7. systematic review: 1篇

D. CAT (CAT論文中有關methodology): 4
1. clarify test structure: 1篇
2. content balance: 1篇
3. compare precision (CAT vs. short form): 1篇
4. improve precision & efficiency: 1篇

E. Mokken analysis (non-parametric IRT analysis, 分開探討): 4
1. concept: 1篇
2. validation: 3篇

F. Other models (較不常見或不熟悉的Rasch/IRT models): 14
1. multi/many-facet Rasch model: 8篇
2. mixed Rasch model: 1篇
3. Thurstonian IRT model: 1篇
4. explanatory item response model: 1篇
5. logistic item response model : 1篇
6. longitudinal IRT model : 1篇
7. unfolding item response theory model: 1篇

G. Unfiled(不確定,尚未分類的論文): 6